وتوفر الزراعة فرص العمل لأكثر من 40 في المائة من السكان وتساهم بحوالي ثلث الناتج المحلي الإجمال حوالي 75 في المائة من أراضي مولدوفا هي منطقة تشيرنوزيم (الأرض السوداء) الخصبة، وتمثل المنتجات الزراعية 75 في المائة من إجمالي الصادرات. تم الاحتفاظ بواحد وعشرين بالمائة من الأراضي الزراعية في مولدوفا كمزارع فردية، و61 بالمائة كمزارع تعاونية، و18 بالمائة كمزارع مملوكة للدولة في عام 1999؛ وفي المجمل، كان هناك 85 ألف مزارع خاص يعملون في جميع أنحاء البلاد. وكانت خصخصة المزارع التعاونية السابقة بطيئة (غير موجودة تقريباً في ترانسنيستريا)، وكان سوق الأراضي صغيراً، لأسباب ليس أقلها أنه لا يُسمح للأجانب بشراء الأراضي. بدأت عملية توحيد المزارع تتجذر حيث تم إنشاء ما يقرب من 10.000 مزرعة كبيرة في عامي 1998 و1999.
وتزرع الحبوب، وعباد الشمس، وبنجر السكر، والبطاطس، والخضروات، والتبغ، والفواكه، والعنب، ولكن زراعة المحاصيل كثيفة رأس المال – التبغ والخضروات – انخفضت بسبب فقدان الأسواق ومحدودية الاستهلاك المحلي. انخفض عدد الماشية بشكل كبير خلال التسعينيات بسبب ارتفاع التكاليف وانخفاض الطلب. تأثر القطاع الزراعي خلال التسعينيات بسبب الجفاف والصقيع والفيضانات ونقص المواد والآلات والأسمدة التي كان الاتحاد السوفييتي يزودها بها. وقد أدت تقنيات الزراعة الأكثر كثافة إلى خفض الإنتاجية بنسبة 35 في المائة. ولا يزال القطاع يتلقى الإعانات والحوافز الضريبية، لكن التدابير التنظيمية الأخيرة (مثل محاولة حظر صادرات القمح) تستمر في صد المستثمرين المحتملين.
